16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_73490 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_73490  predicted protein  100 
 
 
131 aa  260  4.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0660566  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37161  predicted protein  95.42 
 
 
131 aa  248  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.990123  normal  0.458805 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03468  Histone H2A [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08844]  88.03 
 
 
132 aa  209  7.999999999999999e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503847  hitchhiker  0.000000000000165024 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00550  histone H2A-1, putative  79.23 
 
 
131 aa  189  9e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.331035  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12803  predicted protein  78.9 
 
 
121 aa  176  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.349541 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13104  predicted protein  77.98 
 
 
121 aa  175  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.332383 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13304  predicted protein  76.72 
 
 
129 aa  174  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.604396  normal  0.477669 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46020  histone H2A isoform 2  72.41 
 
 
138 aa  173  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26802  histone H2A isoform 3b  75.89 
 
 
126 aa  171  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34798  histone H2A isoform 3a  75.89 
 
 
126 aa  171  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476071  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_9318  predicted protein  61.86 
 
 
128 aa  137  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373768  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28445  histone H2A isoform 1  58.68 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.320484  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04080  histone h2a variant, putative  61.21 
 
 
138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119619  predicted protein  57.69 
 
 
143 aa  128  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.505644  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08039  Histone H2A.Z [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUJ1]  62.39 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.68736  normal  0.469515 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10809  putative CCAAT-box-binding transcription factor (Eurofung)  27.78 
 
 
251 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.846198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>