15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53814 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_53814  predicted protein  100 
 
 		 912 aa  1867    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.68527  normal  0.494406 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10917  conserved hypothetical protein  30.58 
 
 		 1127 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  22.93 
 
 		 423 aa  53.9  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  29.51 
 
 		 413 aa  53.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43936  predicted protein  30.38 
 
 		 1223 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01900  conserved expressed protein  43.75 
 
 		 724 aa  51.2  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.550521  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  22.93 
 
 		 421 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  22.92 
 
 		 437 aa  48.9  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  24.86 
 
 		 454 aa  47.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  21.67 
 
 		 492 aa  46.6  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  21.55 
 
 		 482 aa  47  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  21.37 
 
 		 422 aa  47  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  20.99 
 
 		 484 aa  46.2  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  25.67 
 
 		 451 aa  46.2  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  22.73 
 
 		 422 aa  45.4  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>