15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_53063 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_53063  predicted protein  100 
 
 		 897 aa  1847    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01150  hypothetical protein  26.37 
 
 		 763 aa  270  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.966337  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80516  component of COPII coat of ER- Golgi vesicles  25.33 
 
 		 749 aa  256  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.461247  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00261  Protein transport protein sec23 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGR9]  26.59 
 
 		 771 aa  248  4.9999999999999997e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115458 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42673  predicted protein  25.56 
 
 		 759 aa  233  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76723  predicted protein  26.09 
 
 		 816 aa  200  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.322437 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33543  predicted protein  23.55 
 
 		 771 aa  199  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0336143  normal  0.164519 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16541  predicted protein  23 
 
 		 770 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.700638  normal  0.499516 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03080  vesicle coat complex COPII, subunit Sec24 family protein, putative (Eurofung)  25.85 
 
 		 1031 aa  62.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0488022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44386  predicted protein  25.9 
 
 		 777 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.704659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88822  predicted protein  21.86 
 
 		 774 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  decreased coverage  0.00889443 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13396  predicted protein  22.99 
 
 		 680 aa  48.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47270  predicted protein  32.89 
 
 		 897 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88354  SED5-binding protein 2 (SEC24-related protein 2) component of COPII coat of ER- Golgi vesicles  26.28 
 
 		 907 aa  44.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00260  ER to Golgi transport-related protein, putative  20.89 
 
 		 920 aa  44.3  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00276078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>