12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42673 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00261  Protein transport protein sec23 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGR9]  49.8 
 
 		 771 aa  701    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115458 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01150  hypothetical protein  50.84 
 
 		 763 aa  775    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.966337  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80516  component of COPII coat of ER- Golgi vesicles  47.13 
 
 		 749 aa  685    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.461247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16541  predicted protein  47.39 
 
 		 770 aa  669    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.700638  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33543  predicted protein  46.04 
 
 		 771 aa  686    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0336143  normal  0.164519 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42673  predicted protein  100 
 
 		 759 aa  1576    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76723  predicted protein  38.43 
 
 		 816 aa  522  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.322437 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53063  predicted protein  25.56 
 
 		 897 aa  233  8.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.214435 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47270  predicted protein  28.8 
 
 		 897 aa  59.3  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03080  vesicle coat complex COPII, subunit Sec24 family protein, putative (Eurofung)  20.63 
 
 		 1031 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0488022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13396  predicted protein  21.32 
 
 		 680 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44386  predicted protein  21.96 
 
 		 777 aa  46.6  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.704659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>