84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30809 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_30809  predicted protein  100 
 
 
572 aa  1159    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0100169  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30904  predicted protein  50.72 
 
 
533 aa  538  9.999999999999999e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.779542  normal  0.0693376 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04526  nucleoside transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03000)  32.04 
 
 
538 aa  270  7e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.325263 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01920  cytosine-purine permease, putative  34.76 
 
 
524 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07967  nucleoside transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04690)  31.57 
 
 
551 aa  240  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0687984  normal  0.359192 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01186  purine-cytosine transporter (Eurofung)  29.44 
 
 
505 aa  230  6e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10767  Cytosine-purine permease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B1PXD0]  28.86 
 
 
508 aa  219  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00395029 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06330  purine-cytosine permease, putative  26.96 
 
 
525 aa  193  7e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04210  cytosine-purine permease, putative  27.56 
 
 
523 aa  187  7e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72073  predicted protein  25.78 
 
 
511 aa  187  7e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75870  predicted protein  27.24 
 
 
510 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06783  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 
514 aa  174  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.223057 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04150  cytosine-purine permease, putative  28.43 
 
 
473 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6996  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  27.54 
 
 
473 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181128  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5409  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.79 
 
 
473 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103715  normal  0.0122128 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7084  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.73 
 
 
475 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.083974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2364  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.27 
 
 
475 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0770774  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3034  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25 
 
 
448 aa  73.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1149  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.26 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1867  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.69 
 
 
480 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4415  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4820  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.75 
 
 
487 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3270  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.35 
 
 
471 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0406317 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5793  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.38 
 
 
462 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.610023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0160  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.27 
 
 
528 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.85 
 
 
451 aa  65.1  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82356  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6124  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.71 
 
 
470 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.874343  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5670  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.47 
 
 
473 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6281  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.39 
 
 
491 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.575901 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6419  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.48 
 
 
473 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392951  normal  0.317857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2557  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.1 
 
 
484 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266727  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2267  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.2 
 
 
468 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193361  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2252  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.53 
 
 
470 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2075  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  25.53 
 
 
470 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2248  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.53 
 
 
470 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.1498  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2262  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.8 
 
 
467 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3655  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  25.53 
 
 
470 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0501993  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5706  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.69 
 
 
479 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  0.11286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2090  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  24.93 
 
 
468 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00352517  normal  0.665422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2066  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.07 
 
 
534 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3641  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  24.93 
 
 
467 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0564  hypothetical protein  22.33 
 
 
487 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6647  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  26.43 
 
 
469 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104211  normal  0.0424999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2142  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.12 
 
 
453 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0460  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.17 
 
 
502 aa  54.7  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4383  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  24.6 
 
 
476 aa  54.7  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2519  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  25.49 
 
 
474 aa  54.3  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0831  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  25.49 
 
 
474 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.831321  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0417  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  25.1 
 
 
474 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1795  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  25.1 
 
 
474 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0465  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  25.1 
 
 
474 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.446257  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1140  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.79 
 
 
476 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1249  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.79 
 
 
476 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960267  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1221  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.79 
 
 
476 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2380  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  25.49 
 
 
474 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1004  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.29 
 
 
527 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173483  normal  0.212686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1129  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.4 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3261  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.24 
 
 
468 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3283  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0867  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.28 
 
 
487 aa  50.8  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.460457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0743  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  25.9 
 
 
499 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263907  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2484  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.61 
 
 
464 aa  50.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.307403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3383  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.66 
 
 
463 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0709  NCS1 nucleoside transporter  25.9 
 
 
499 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0743  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.9 
 
 
499 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0628  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  26.03 
 
 
474 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6361  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.14 
 
 
481 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6019  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.36 
 
 
480 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213946  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3052  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.39 
 
 
459 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1011  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  26.34 
 
 
504 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0282694  normal  0.259708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3920  putative transporter  27.49 
 
 
503 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5704  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.09 
 
 
490 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323568  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4474  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.1 
 
 
500 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46100  putative transporter  27.49 
 
 
503 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.504588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5614  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.06 
 
 
486 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493081  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3607  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.26 
 
 
474 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013124  Afer_1410  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.13 
 
 
458 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_06900  purine-cytosine permease-like transporter  25 
 
 
483 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93221  normal 
 
 
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NC_010086  Bmul_3933  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.07 
 
 
505 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.224064  normal 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1424  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  24.7 
 
 
480 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_1878  putative transporter  23.64 
 
 
511 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_0862  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.55 
 
 
507 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.472129  normal  0.0659585 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1455  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.16 
 
 
503 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.187023  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3218  transporter membrane subunit  24.3 
 
 
476 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_1514  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.94 
 
 
528 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
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