13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46954 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46954  predicted protein  100 
 
 
720 aa  1510    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0187117  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49381  predicted protein  24.49 
 
 
969 aa  153  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.158773  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43943  predicted protein  27.89 
 
 
799 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36115  predicted protein  27.53 
 
 
782 aa  140  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000280602  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32339  predicted protein  24.85 
 
 
666 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.000000123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33478  predicted protein  25.14 
 
 
428 aa  67  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00955149  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00250  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 
920 aa  50.8  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0427747  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05540  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 
678 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.202932  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00740  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 
932 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00050  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 
580 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0518448  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02790  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 
895 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01320  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 
932 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.154568  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40716  predicted protein  28.23 
 
 
542 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>