23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46762 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_46762  predicted protein  100 
 
 
461 aa  933    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.013384  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44027  predicted protein  38.59 
 
 
472 aa  250  3e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.361974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 
302 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  25.66 
 
 
310 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 
302 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  26.25 
 
 
283 aa  61.6  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 
298 aa  60.1  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  26.5 
 
 
308 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  26.94 
 
 
305 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  26.22 
 
 
300 aa  58.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 
300 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.37 
 
 
302 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  24.74 
 
 
297 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  25.18 
 
 
297 aa  50.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.5 
 
 
317 aa  49.3  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.78 
 
 
305 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  27.27 
 
 
288 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  23.55 
 
 
296 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  24.32 
 
 
294 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  24.32 
 
 
294 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  25.82 
 
 
296 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  23.53 
 
 
294 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  23.53 
 
 
294 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>