11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48183 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48183  predicted protein  100 
 
 
254 aa  520  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49858  predicted protein  33.33 
 
 
263 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38531  predicted protein  33.06 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49055  predicted protein  34.27 
 
 
256 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49862  predicted protein  28.19 
 
 
295 aa  89  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000281678  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32984  predicted protein  31.47 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41403  predicted protein  27.98 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0716194  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48071  predicted protein  25 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37743  predicted protein  23.6 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48069  predicted protein  23.08 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48137  predicted protein  24.28 
 
 
379 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>