10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48071 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48071  predicted protein  100 
 
 
284 aa  589  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48069  predicted protein  42.46 
 
 
283 aa  172  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32984  predicted protein  29.26 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48137  predicted protein  29.71 
 
 
379 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48183  predicted protein  25 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49055  predicted protein  27.52 
 
 
256 aa  56.2  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38531  predicted protein  28.72 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49858  predicted protein  27.73 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41403  predicted protein  27.32 
 
 
274 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0716194  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49862  predicted protein  25.86 
 
 
295 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000281678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>