30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45921 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45921  predicted protein  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_7656  predicted protein  44.55 
 
 
104 aa  94  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40447  predicted protein  32.91 
 
 
441 aa  89  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12237  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_7528  predicted protein  33.33 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48643  predicted protein  43.01 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0241442  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0378  Redoxin domain protein  32.23 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.119987  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2290  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.41 
 
 
186 aa  52.8  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.348422 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50197  predicted protein  24.83 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3992  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.24 
 
 
376 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.984971  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  27.41 
 
 
154 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2010  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.56 
 
 
399 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1354  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.84 
 
 
372 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6429  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.68 
 
 
715 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0633633  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1632  Redoxin domain protein  30.36 
 
 
190 aa  45.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.565368  normal  0.246886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2577  thioredoxin  36.99 
 
 
162 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09641  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2877  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.09 
 
 
376 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1547  redoxin domain-containing protein  29.29 
 
 
155 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0375508  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.5 
 
 
455 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  26.76 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  23.44 
 
 
191 aa  43.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3993  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.66 
 
 
378 aa  42.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.605498  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13208  thiol:disulfide interchange protein  29.2 
 
 
369 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.281994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  23.91 
 
 
109 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0031  redoxin  26.79 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1448  thioredoxin family protein  31.96 
 
 
390 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00492149  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40 
 
 
390 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5143  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.35 
 
 
284 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000973211  hitchhiker  0.00708488 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45770  predicted protein  24.24 
 
 
288 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1834  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.73 
 
 
381 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0452  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.58 
 
 
381 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0250158  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>