17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39727 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_39727  predicted protein  100 
 
 
411 aa  840    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44118  predicted protein  44.34 
 
 
409 aa  291  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100298  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26807  predicted protein  43.26 
 
 
331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56066  predicted protein  27.71 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07130  vacuolar membrane protein, putative  31.69 
 
 
434 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.597125  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88914  DMT family transporter  28.09 
 
 
442 aa  95.5  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166114  hitchhiker  0.00120793 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00088  integral membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12140)  25.65 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45501  predicted protein  20.66 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0509541  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.22 
 
 
296 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  59.18 
 
 
277 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  35.85 
 
 
316 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30 
 
 
286 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  34.85 
 
 
308 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  43.94 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.8 
 
 
299 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  35.65 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 
286 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>