26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56066 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_56066  predicted protein  100 
 
 
404 aa  815    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00088  integral membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12140)  36.61 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC07130  vacuolar membrane protein, putative  34.03 
 
 
434 aa  199  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.597125  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45501  predicted protein  29.49 
 
 
406 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0509541  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39727  predicted protein  27.71 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26807  predicted protein  27.15 
 
 
331 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44118  predicted protein  24.73 
 
 
409 aa  86.7  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100298  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88914  DMT family transporter  24.47 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0166114  hitchhiker  0.00120793 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00674  DUF6 domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13340)  26.05 
 
 
319 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.281461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  23.43 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80841  conserved hypothetical protein  25 
 
 
488 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.801804  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  34.74 
 
 
310 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.87 
 
 
302 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  23.63 
 
 
330 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28 
 
 
299 aa  47  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1850  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 
308 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.152184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  31.15 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  33.67 
 
 
300 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  40.58 
 
 
288 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.08 
 
 
305 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  38.55 
 
 
316 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  26.92 
 
 
304 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  25.88 
 
 
266 aa  42.7  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  39.34 
 
 
277 aa  42.7  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>