13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37731 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_37731  predicted protein  100 
 
 
1373 aa  2805    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50367  predicted protein  67.16 
 
 
230 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46052  predicted protein  67.16 
 
 
315 aa  102  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.283581  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_40578  predicted protein  51.9 
 
 
860 aa  101  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48581  predicted protein  67.16 
 
 
328 aa  101  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.047203  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03923  ubiquitin-protein ligase E3 component (UBR1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08420)  42.31 
 
 
2159 aa  78.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362385  normal  0.693019 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03650  ubiquitin-protein ligase, putative  40.23 
 
 
1840 aa  73.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28643  predicted protein  39.71 
 
 
1931 aa  67.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.272891  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64920  predicted protein  40 
 
 
1802 aa  64.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.904331 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5059  amidohydrolase 2  43.66 
 
 
319 aa  48.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5801  amidohydrolase 2  43.66 
 
 
319 aa  48.9  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0396763  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3060  amidohydrolase 2  36.84 
 
 
322 aa  47  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4378  amidohydrolase 2  42.86 
 
 
320 aa  46.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>