16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35561 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_35561  predicted protein  100 
 
 		 449 aa  934    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.742828  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31282  predicted protein  31.88 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.592306  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34381  predicted protein  39.13 
 
 		 319 aa  57  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693095  normal  0.168449 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06501  splicing factor 3b subunit 4 (AFU_orthologue; AFUA_6G05180)  35.35 
 
 		 352 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  35.44 
 
 		 95 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 98 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  29.49 
 
 		 98 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03800  telomere maintenance protein, putative  38.75 
 
 		 951 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.523951  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03800  telomere maintenance protein, putative  38.75 
 
 		 931 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1761  RNP-1 like RNA-binding protein  35.44 
 
 		 96 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  36.25 
 
 		 499 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  28.21 
 
 		 104 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04000  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein)(PABP)(Polyadenylate tail-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B630]  32 
 
 		 732 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.175791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  35.06 
 
 		 107 aa  43.5  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  30.95 
 
 		 97 aa  43.1  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  32 
 
 		 319 aa  43.1  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>