20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1236 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1236  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1338  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.01 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.164705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3890  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.82 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3989  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.82 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3967  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.82 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4083  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.33 
 
 		 269 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0155994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2414  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.37 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3576  hypothetical protein  22.27 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.421101  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2293  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  21.52 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00571035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4649  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  20.49 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  0.343196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4302  hypothetical protein  20.09 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3627  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.92 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0397  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.92 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000185602  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0398  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.92 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0161377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3236  hypothetical protein  20.35 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0383  hypothetical protein  21.49 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1251  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  20.43 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.964193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0492  hypothetical protein  19.18 
 
 		 238 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0328  hypothetical protein  19.23 
 
 		 238 aa  42  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0203423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4124  hypothetical protein  19.28 
 
 		 236 aa  42  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.403684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>