27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0452 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0452  hypothetical protein  100 
 
 		 715 aa  1469    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.444475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4026  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.59 
 
 		 698 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4724  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.12 
 
 		 705 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6025  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.3 
 
 		 706 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0984215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0741  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.51 
 
 		 702 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000309287 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0756  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.77 
 
 		 696 aa  130  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0418  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.17 
 
 		 705 aa  119  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1209  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PpiC-type  25.27 
 
 		 697 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1415  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  24.93 
 
 		 699 aa  97.4  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1922  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PpiC-type  23.77 
 
 		 701 aa  93.2  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0039  hypothetical protein  22.75 
 
 		 597 aa  88.6  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04195  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PpiC-type  23.9 
 
 		 700 aa  88.2  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2608  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.93 
 
 		 705 aa  87.8  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3268  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.55 
 
 		 697 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0336  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.19 
 
 		 694 aa  85.1  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0262  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.76 
 
 		 701 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0362  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.93 
 
 		 701 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0908729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0340  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  21.97 
 
 		 700 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0268  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.15 
 
 		 631 aa  48.9  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3722  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, putative  25.36 
 
 		 627 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76996  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0785  hypothetical protein  24.76 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.954902 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  24.62 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0015  SurA domain  25.95 
 
 		 438 aa  45.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00201021  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0887  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.69 
 
 		 249 aa  45.1  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0142655  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2372  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  22.17 
 
 		 639 aa  44.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000220409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5399  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  29.32 
 
 		 632 aa  44.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1929  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.47 
 
 		 629 aa  43.9  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.292959  normal  0.0390357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>