107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3939 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3939  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
161 aa  340  7e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2129  GCN5-related N-acetyltransferase  58.74 
 
 
149 aa  187  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0021  GCN5-related N-acetyltransferase  59.29 
 
 
145 aa  167  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0020  GCN5-related N-acetyltransferase  57.34 
 
 
151 aa  160  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0314229  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2555  acetyltransferase  43.85 
 
 
144 aa  124  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22360  GCN5-related N-acetyltransferase protein  42.11 
 
 
148 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0779  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
141 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2736  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3516  histone acetyltransferase HPA2/related acetyltransferase  42.65 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
147 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0440929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3730  GCN5-related N-acetyltransferase  42.65 
 
 
147 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765568  normal  0.328429 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4241  GCN5-related N-acetyltransferase  41.91 
 
 
147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.130099  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4823  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
143 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  41.91 
 
 
147 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1753  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 
152 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5536  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.710156  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3490  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0373267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4876  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5410  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00351  acetyltransferase, gnat family  40.15 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 
152 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2181  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 
152 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  40.16 
 
 
141 aa  107  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000337844  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1201  hypothetical protein  34.97 
 
 
144 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0512549  normal  0.879636 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0894  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
142 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.250952  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003043  acetyltransferase GNAT family  35.71 
 
 
141 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0954  acetyltransferase  37.23 
 
 
139 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0845  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
147 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.084363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3327  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
139 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5407  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 
144 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0501426  normal  0.511997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
144 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1756  acetyltransferase (GNAT) family protein  41.41 
 
 
213 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.896774  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3224  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
139 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1373  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
133 aa  99.8  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4809  GCN5-related N-acetyltransferase  36.3 
 
 
144 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546548  hitchhiker  0.000000000531373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3418  GCN5-related N-acetyltransferase  40.31 
 
 
143 aa  97.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259832  hitchhiker  0.00983825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0846  GCN5-related N-acetyltransferase  34.56 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3521  GCN5-related N-acetyltransferase  34.56 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02843  acetyltransferase  44.23 
 
 
115 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3640  GCN5-related N-acetyltransferase  34.56 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3446  GCN5-related N-acetyltransferase  34.56 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2314  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233708  hitchhiker  0.000416067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1523  GCN5-related N-acetyltransferase  36.64 
 
 
144 aa  95.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.202998  normal  0.0804115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0617  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
147 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.351006  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0465  GCN5-related N-acetyltransferase  34.35 
 
 
163 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0974  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2436  hypothetical protein  34.97 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4975  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
154 aa  88.6  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2929  acetyltransferase  41.67 
 
 
133 aa  87.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.031878  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4392  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0063  GCN5-related protein N-acetyltransferase  37.39 
 
 
144 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.607567 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2231  acetyltransferase  33.86 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02800  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  37.12 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0901  acetyltransferase  38.68 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0989  hypothetical protein  38.68 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502431  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
148 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0070  hypothetical protein  37.74 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00773561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1780  GCN5-related N-acetyltransferase  32.06 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258903  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05330  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03350)  33.57 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1996  acetyltransferase  31.4 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0028  acetyltransferase  31.67 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0235  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4799  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.558764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1391  GCN5-related N-acetyltransferase  33.6 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.13219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13460  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 
138 aa  60.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
156 aa  58.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565261  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2632  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5258  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3471  GCN5-related N-acetyltransferase  34.74 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107886  normal  0.412384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0993  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0565892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4204  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4243  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0386103  hitchhiker  0.0000983104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2240  hypothetical protein  30.21 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0216182  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  28.72 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000434676  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1193  acetyltransferase  27.61 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1749  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1379  acetyltransferase  28.46 
 
 
140 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000349378  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21101  GNAT family acetyltransferase  27.72 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1733  GNAT family acetyltransferase  23.08 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.804122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4968  GCN5-like N-acetyltransferase  31.58 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.168683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1906  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
137 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.537884  hitchhiker  0.0000285957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0427497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175787  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0550  acetyltransferase, GNAT family  27.47 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000998948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2832  acetyltransferase  35.29 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2612  acetyltransferase  34.78 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0440411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2802  acetyltransferase  34.78 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.613256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1645  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0048  GCN5-related N-acetyltransferase  29.36 
 
 
359 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2810  acetyltransferase, GNAT family  34.78 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000256383 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18311  GNAT family acetyltransferase  22.22 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.662175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2108  GCN5-related N-acetyltransferase  26.36 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2560  acetyltransferase  33.82 
 
 
134 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0379943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2606  GCN5-related N-acetyltransferase  34.33 
 
 
134 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.504946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2529  acetyltransferase  33.33 
 
 
134 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0100563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0060  GCN5-related N-acetyltransferase  28.44 
 
 
361 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.461775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1817  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 
138 aa  43.9  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0569888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2852  acetyltransferase, GNAT family  32.35 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000771484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>