141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2436 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2436  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  339  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  81.41 
 
 		 158 aa  260  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2314  GCN5-related N-acetyltransferase  80.13 
 
 		 158 aa  257  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233708  hitchhiker  0.000416067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1201  hypothetical protein  50.34 
 
 		 144 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0512549  normal  0.879636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5407  GCN5-related N-acetyltransferase  49.66 
 
 		 144 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0501426  normal  0.511997 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003043  acetyltransferase GNAT family  49.63 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2736  GCN5-related N-acetyltransferase  47.37 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2555  acetyltransferase  45.52 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3516  histone acetyltransferase HPA2/related acetyltransferase  49.25 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5536  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.710156  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4823  GCN5-related N-acetyltransferase  44.76 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1756  acetyltransferase (GNAT) family protein  48.57 
 
 		 213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.896774  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  45.27 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3490  GCN5-related N-acetyltransferase  45.7 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0373267  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4241  GCN5-related N-acetyltransferase  44.59 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.130099  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4876  GCN5-related N-acetyltransferase  45.7 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0845  GCN5-related N-acetyltransferase  45.95 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.084363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5410  GCN5-related N-acetyltransferase  45.27 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02800  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  46.76 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3730  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765568  normal  0.328429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0779  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 		 141 aa  120  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3521  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3446  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0954  acetyltransferase  42.14 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0894  GCN5-related N-acetyltransferase  42.25 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.250952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  40.69 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3640  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 		 139 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0846  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 		 140 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4975  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0440929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3327  GCN5-related N-acetyltransferase  44.36 
 
 		 139 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02843  acetyltransferase  46.9 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00351  acetyltransferase, gnat family  44.68 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3224  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4809  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 		 144 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546548  hitchhiker  0.000000000531373 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2231  acetyltransferase  43.61 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0063  GCN5-related protein N-acetyltransferase  42.03 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.607567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1753  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2129  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 		 149 aa  97.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22360  GCN5-related N-acetyltransferase protein  34.29 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2181  GCN5-related N-acetyltransferase  42.52 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1523  GCN5-related N-acetyltransferase  40.15 
 
 		 144 aa  96.3  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.202998  normal  0.0804115 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  41.73 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0235  GCN5-related N-acetyltransferase  44.54 
 
 		 154 aa  94.4  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0901  acetyltransferase  43.75 
 
 		 212 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3418  GCN5-related N-acetyltransferase  41.09 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259832  hitchhiker  0.00983825 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0070  hypothetical protein  43.75 
 
 		 212 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00773561  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0465  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1780  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  39.17 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000337844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4392  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1373  GCN5-related N-acetyltransferase  41.48 
 
 		 133 aa  88.6  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3939  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 		 161 aa  88.6  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0989  hypothetical protein  45.45 
 
 		 239 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502431  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0028  acetyltransferase  35.2 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1996  acetyltransferase  35.2 
 
 		 153 aa  87.8  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  36.5 
 
 		 148 aa  84.3  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0021  GCN5-related N-acetyltransferase  42.4 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0974  GCN5-related N-acetyltransferase  34.06 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4799  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.558764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0020  GCN5-related N-acetyltransferase  42.28 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0314229  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0617  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.351006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1391  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.13219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0060  GCN5-related N-acetyltransferase  37.61 
 
 		 361 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.461775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2929  acetyltransferase  30.65 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.031878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0048  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 		 359 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5549  GCN5-related N-acetyltransferase  34.35 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1231  putative acetyltransferase, GNAT family  22.66 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0044  GCN5-related N-acetyltransferase  39.09 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4968  GCN5-like N-acetyltransferase  31.78 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.168683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1949  GCN5-related N-acetyltransferase  34.45 
 
 		 361 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494681  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05330  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03350)  28.81 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5258  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0079  hypothetical protein  29.57 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.668826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2240  hypothetical protein  28.45 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0216182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  38.39 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0373782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21101  GNAT family acetyltransferase  27.43 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4121  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1392  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182115  normal  0.0388406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1749  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0740  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0079  hypothetical protein  28.47 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1379  acetyltransferase  32.91 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000349378  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.60586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43627  predicted protein  31.36 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4973  GCN5-like N-acetyltransferase  36.61 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000872655  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1693  GCN5-related N-acetyltransferase  35.64 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1193  acetyltransferase  30.38 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123933  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0993  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0565892 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0550  acetyltransferase, GNAT family  32.14 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000998948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 		 135 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175787  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3028  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2108  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000434676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1794  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000157192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0543  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.5 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>