132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2314 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2314  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
158 aa  323  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233708  hitchhiker  0.000416067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  97.47 
 
 
158 aa  317  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2436  hypothetical protein  80.13 
 
 
165 aa  257  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.688717  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1201  hypothetical protein  50.34 
 
 
144 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0512549  normal  0.879636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5407  GCN5-related N-acetyltransferase  50.34 
 
 
144 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0501426  normal  0.511997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4241  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
147 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.130099  normal  0.116097 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5410  GCN5-related N-acetyltransferase  48.98 
 
 
147 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4764  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
147 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3730  GCN5-related N-acetyltransferase  48.94 
 
 
147 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.765568  normal  0.328429 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3490  GCN5-related N-acetyltransferase  48.98 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0373267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4876  GCN5-related N-acetyltransferase  48.98 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1756  acetyltransferase (GNAT) family protein  48.97 
 
 
213 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.896774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0845  GCN5-related N-acetyltransferase  48.63 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.084363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5536  GCN5-related N-acetyltransferase  51.54 
 
 
139 aa  127  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.710156  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2736  GCN5-related N-acetyltransferase  45.27 
 
 
146 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2555  acetyltransferase  43.54 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4823  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
143 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003043  acetyltransferase GNAT family  46.67 
 
 
141 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3516  histone acetyltransferase HPA2/related acetyltransferase  45.11 
 
 
140 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  42.36 
 
 
142 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00351  acetyltransferase, gnat family  45 
 
 
147 aa  114  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0846  GCN5-related N-acetyltransferase  45.32 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3521  GCN5-related N-acetyltransferase  45.32 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3446  GCN5-related N-acetyltransferase  45.32 
 
 
139 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02800  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  42.45 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02843  acetyltransferase  48.21 
 
 
115 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1633  GCN5-related N-acetyltransferase  40.82 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0440929 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0779  GCN5-related N-acetyltransferase  44.78 
 
 
141 aa  110  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3640  GCN5-related N-acetyltransferase  44.6 
 
 
139 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0954  acetyltransferase  40.71 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3327  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
139 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  43.2 
 
 
144 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0894  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
142 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.250952  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2231  acetyltransferase  44.03 
 
 
213 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2129  GCN5-related N-acetyltransferase  45.6 
 
 
149 aa  103  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3224  GCN5-related N-acetyltransferase  43.33 
 
 
139 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4975  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
154 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22360  GCN5-related N-acetyltransferase protein  35.86 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4809  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546548  hitchhiker  0.000000000531373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3939  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2181  GCN5-related N-acetyltransferase  42.25 
 
 
152 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  40.85 
 
 
152 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0063  GCN5-related protein N-acetyltransferase  36.96 
 
 
144 aa  91.7  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.607567 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0901  acetyltransferase  45.45 
 
 
212 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.675572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1753  GCN5-related N-acetyltransferase  42.06 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0235  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0021  GCN5-related N-acetyltransferase  41.43 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0070  hypothetical protein  45.45 
 
 
212 aa  90.5  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00773561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0989  hypothetical protein  45.45 
 
 
239 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502431  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1523  GCN5-related N-acetyltransferase  39.42 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.202998  normal  0.0804115 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0028  acetyltransferase  36.43 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1996  acetyltransferase  36.43 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3418  GCN5-related N-acetyltransferase  40.94 
 
 
143 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259832  hitchhiker  0.00983825 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0020  GCN5-related N-acetyltransferase  42.06 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0314229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1780  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258903  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1373  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  38.06 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000337844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4392  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0465  GCN5-related N-acetyltransferase  36.5 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0154869 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0617  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.351006  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0974  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1391  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.13219  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2929  acetyltransferase  31.45 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.031878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4799  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
177 aa  61.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.558764 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05330  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03350)  28.81 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5549  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
217 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693034  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1231  putative acetyltransferase, GNAT family  22.41 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4968  GCN5-like N-acetyltransferase  29.46 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5258  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
136 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0060  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
361 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.461775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  30.09 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565261  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21101  GNAT family acetyltransferase  26.96 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2240  hypothetical protein  32.35 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0216182  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000434676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
183 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0373782  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0048  GCN5-related N-acetyltransferase  34.82 
 
 
359 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0079  hypothetical protein  30.4 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.668826  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.60586  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43627  predicted protein  33.07 
 
 
163 aa  47.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0993  GCN5-related N-acetyltransferase  24.79 
 
 
162 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0565892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6192  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
144 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1193  acetyltransferase  31.33 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1693  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1733  GNAT family acetyltransferase  22.88 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.804122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4973  GCN5-like N-acetyltransferase  33.62 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000872655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0044  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 
355 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3028  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1749  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1379  acetyltransferase  32.14 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000349378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4783  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  21.49 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000302728  hitchhiker  0.00000145166 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01210  acetyltransferase (GNAT) family protein  39.47 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1949  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 
361 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494681  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1451  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
174 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00911  putative acetyltransferase, GNAT family  27.5 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0344601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0543  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.76 
 
 
139 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4121  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0550  acetyltransferase, GNAT family  31 
 
 
140 aa  44.3  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000998948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2832  acetyltransferase  33.33 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0167609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>