13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1242 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1242  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0109336  normal  0.90269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3198  HicA protein  36.9 
 
 		 93 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3122  hypothetical protein  24.65 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000156322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0021  HicA protein  34.33 
 
 		 88 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405452  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1369  hypothetical protein  32.43 
 
 		 84 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2213  hypothetical protein  27.27 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2192  HicA protein  32.39 
 
 		 83 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0436  HicA protein  30.23 
 
 		 98 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502999  normal  0.94086 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0422  HicA-related protein  32.43 
 
 		 84 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1427  HicA-related protein  32.43 
 
 		 84 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2251  HicA protein  29.87 
 
 		 84 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2261  HicA protein  31.17 
 
 		 84 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2592  HicA-related protein  31.08 
 
 		 89 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.920641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>