16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27638 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_27638  predicted protein  100 
 
 
358 aa  728    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136627  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88172  predicted protein  31.07 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.123803  normal  0.573363 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31875  predicted protein  23.97 
 
 
526 aa  56.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  30.73 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0749  patatin  27.86 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  26.79 
 
 
256 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  26.95 
 
 
251 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  28.8 
 
 
1065 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  27.16 
 
 
312 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  27.14 
 
 
406 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  31.36 
 
 
250 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  31.67 
 
 
581 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4687  patatin  27.91 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257253  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  29.38 
 
 
583 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  25.93 
 
 
317 aa  43.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  25.73 
 
 
263 aa  42.7  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>