18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2772 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2772  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3571  hypothetical protein  81.94 
 
 		 73 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4705  hypothetical protein  74.58 
 
 		 70 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4029  hypothetical protein  78.18 
 
 		 73 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7002  hypothetical protein  59.49 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.822642  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1387  hypothetical protein  74 
 
 		 73 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1367  hypothetical protein  72 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3028  hypothetical protein  53.33 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5007  hypothetical protein  52.27 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351742  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4398  hypothetical protein  52.17 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519586  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3130  hypothetical protein  55.56 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.81644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2904  hypothetical protein  52.27 
 
 		 49 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2726  hypothetical protein  55.26 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1363  hypothetical protein  46 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1033  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  40 
 
 		 246 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0285  hypothetical protein  43.24 
 
 		 94 aa  40.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2780  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2557  response regulator receiver  40.91 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>