17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4705 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4705  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1367  hypothetical protein  82.26 
 
 		 72 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1387  hypothetical protein  74.29 
 
 		 73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4029  hypothetical protein  66.67 
 
 		 73 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7002  hypothetical protein  60.26 
 
 		 78 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.822642  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3571  hypothetical protein  66.67 
 
 		 73 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2772  hypothetical protein  74.58 
 
 		 72 aa  87.4  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3028  hypothetical protein  50.98 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5007  hypothetical protein  58.54 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351742  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3130  hypothetical protein  51.02 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.81644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2726  hypothetical protein  53.66 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2904  hypothetical protein  47.92 
 
 		 49 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4398  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1363  hypothetical protein  48.65 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0285  hypothetical protein  37.29 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180961 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2931  hypothetical protein  40.32 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1273  hypothetical protein  40.32 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.523941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>