13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0285 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0285  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  189  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3240  hypothetical protein  52.63 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4029  hypothetical protein  44.23 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7002  hypothetical protein  51.43 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.822642  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5007  hypothetical protein  34.94 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351742  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3571  hypothetical protein  47.37 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3130  hypothetical protein  42.55 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.81644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0090  hypothetical protein  48.48 
 
 		 61 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81517  normal  0.0401934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4705  hypothetical protein  37.29 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4398  hypothetical protein  46.88 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519586  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3025  hypothetical protein  51.52 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2772  hypothetical protein  43.24 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3277  hypothetical protein  51.52 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>