15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4398 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4398  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  150  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.519586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2726  hypothetical protein  78.12 
 
 		 72 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3028  hypothetical protein  63.16 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.181038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3130  hypothetical protein  63.16 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.81644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5007  hypothetical protein  55.26 
 
 		 91 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0351742  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2904  hypothetical protein  66.67 
 
 		 49 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2772  hypothetical protein  52.17 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7002  hypothetical protein  51.16 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.822642  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1387  hypothetical protein  52.63 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1367  hypothetical protein  46.67 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3571  hypothetical protein  47.83 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4705  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4029  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.183485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6449  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.38 
 
 		 239 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.983426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0285  hypothetical protein  46.88 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>