18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2206 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2206  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2157  transcriptional regulator, AbrB family  43.48 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0686  AbrB family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000129659  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0253  AbrB family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1402  transcriptional regulator, AbrB family  38.71 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000475988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2576  AbrB family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2861  AbrB family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0225  AbrB family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3590  hypothetical protein  34.29 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000966355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3242  transcriptional regulator, AbrB family  31.17 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2558  transcriptional regulator, AbrB family  39.39 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1405  AbrB family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1655  transcriptional regulator, AbrB family  38.71 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.336851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0060  transcriptional regulator, AbrB family  35.48 
 
 		 81 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000160272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3325  hypothetical protein  29.69 
 
 		 73 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103308  normal  0.22148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2425  AbrB family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2107  AbrB family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.15815  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0196  AbrB family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>