16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1302 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1302  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  192  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.470443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  55.84 
 
 
227 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  44.83 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  42.86 
 
 
171 aa  51.2  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  47.73 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  45.65 
 
 
196 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  44 
 
 
216 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  48.78 
 
 
163 aa  42.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  43.48 
 
 
194 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  40.82 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  45.1 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  33.9 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  40 
 
 
199 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  52.78 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  31.03 
 
 
185 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  35.94 
 
 
153 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>