22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1537 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1537  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
100 aa  207  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339298 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1765  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  84.38 
 
 
99 aa  179  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0453  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.24 
 
 
445 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0476  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.79 
 
 
455 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.93 
 
 
443 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.21 
 
 
378 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.24 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  39.34 
 
 
443 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0730  pyruvate--ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  31.25 
 
 
1208 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.44 
 
 
418 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 
284 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  35.37 
 
 
435 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2557  NADH dehydrogenase subunit I  29.03 
 
 
162 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.840778  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2364  protein of unknown function DUF362  35.29 
 
 
376 aa  41.2  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1150  NADH dehydrogenase subunit I  31.43 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1503  hydrogenase, Fe-only  36.92 
 
 
418 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  35.59 
 
 
460 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.68 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1687  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
293 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1750  NADH dehydrogenase subunit I  29.33 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  40.98 
 
 
318 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.75 
 
 
289 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.526028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>