17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1765 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1765  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
99 aa  202  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1537  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  84.38 
 
 
100 aa  179  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000339298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0453  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.24 
 
 
445 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.613143 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  37.29 
 
 
460 aa  42  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.72 
 
 
378 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0476  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.32 
 
 
455 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0730  pyruvate--ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  30 
 
 
1208 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.49 
 
 
443 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0912  Fe-S cluster domain protein  39.34 
 
 
443 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0761  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.11 
 
 
368 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2860  hydrogenase 4 subunit H  28.57 
 
 
179 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.48 
 
 
369 aa  40.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2622  hydrogenase 4 subunit H  27.38 
 
 
179 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.85 
 
 
284 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.200567  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1188  hydrogenase 4 subunit H  27.38 
 
 
179 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40586 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02342  hypothetical protein  27.38 
 
 
179 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02380  hydrogenase 4, Fe-S subunit  27.38 
 
 
179 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>