21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0340 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0340  Gas vesicle K  100 
 
 
114 aa  219  7e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2368  Gas vesicle K  79.82 
 
 
114 aa  160  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1487  gas vesicle K  37.93 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.48089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  42.31 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0337  hypothetical protein  43.84 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  42.5 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  42.5 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  42.5 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0072  gas vesicle K  37.93 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349915  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  46.05 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  43.04 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  40.68 
 
 
120 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3389  gas vesicle K  39.76 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  34.78 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  37.93 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6862  hypothetical protein  42.37 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3024  hypothetical protein  30.14 
 
 
104 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524759  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  36.51 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3257  gas vesicle K  34.18 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.224981 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3575  putative gas vesicle synthesis protein  34.18 
 
 
110 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2332  gas vesicle K  35.09 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>