21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0072 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0072  gas vesicle K  100 
 
 
104 aa  199  9e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349915  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1487  gas vesicle K  73.27 
 
 
105 aa  149  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.48089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  56.18 
 
 
96 aa  103  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0337  hypothetical protein  55 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3024  hypothetical protein  53.06 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524759  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0340  Gas vesicle K  37.93 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  38.46 
 
 
116 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2368  Gas vesicle K  34.69 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  39.71 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  36.76 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  36.76 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  36.76 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  37.68 
 
 
120 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3575  putative gas vesicle synthesis protein  32.39 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3257  gas vesicle K  32.39 
 
 
110 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.224981 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  36.51 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  35.29 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6862  hypothetical protein  30.99 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3389  gas vesicle K  40.35 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2332  gas vesicle K  32.08 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  35 
 
 
157 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.367322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>