22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2827 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  183  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1487  gas vesicle K  60.92 
 
 		 105 aa  110  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.48089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0072  gas vesicle K  56.18 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0337  hypothetical protein  56.79 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0340  Gas vesicle K  42.31 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  47.14 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3024  hypothetical protein  48.31 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2368  Gas vesicle K  44.87 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  36.76 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  36.76 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  36.76 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  36.76 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  39.71 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  39.68 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  33.8 
 
 		 116 aa  52.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3257  gas vesicle K  33.33 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.224981 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3575  putative gas vesicle synthesis protein  33.33 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  33.8 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6862  hypothetical protein  35.94 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3389  gas vesicle K  40 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2332  gas vesicle K  32.79 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0074  gas vesicle protein GVPa  39.62 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>