17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3024 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3024  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  202  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.524759  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1487  gas vesicle K  55.56 
 
 
105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.48089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0072  gas vesicle K  53.06 
 
 
104 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0337  hypothetical protein  57 
 
 
123 aa  87.4  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  48.31 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0340  Gas vesicle K  29.79 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  36.76 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2368  Gas vesicle K  31.91 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  34.62 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  38.33 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  38.33 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  38.33 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  32.05 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  36.23 
 
 
110 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  32.35 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  34.85 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0074  gas vesicle protein GVPa  37.04 
 
 
157 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>