20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1801 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  100 
 
 		 114 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  71.05 
 
 		 116 aa  159  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  56.25 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  55.56 
 
 		 96 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  55.56 
 
 		 96 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  55.56 
 
 		 96 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  53.19 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3389  gas vesicle K  54.95 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6862  hypothetical protein  52.87 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  52.27 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3257  gas vesicle K  48.28 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.224981 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3575  putative gas vesicle synthesis protein  48.28 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  44.57 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0074  gas vesicle protein GVPa  47.44 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2332  gas vesicle K  42.86 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1487  gas vesicle K  41.27 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.48089  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  39.68 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0337  hypothetical protein  44.44 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0072  gas vesicle K  36.51 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0340  Gas vesicle K  37.93 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>