19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3257 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3575  putative gas vesicle synthesis protein  100 
 
 		 110 aa  213  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3257  gas vesicle K  100 
 
 		 110 aa  213  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.224981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2406  gas vesicle K  50.56 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.664539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6862  hypothetical protein  53.66 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.305883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0706  hypothetical protein  50.6 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3389  gas vesicle K  51.22 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.209261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2382  gas vesicle K  48.86 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1801  Gas vesicle K  48.28 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2388  gas vesicle K  48.86 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2341  gas vesicle K  48.86 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4699  Gas vesicle K  54.22 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2348  Gas vesicle K  50 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.367322 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1261  gas vesicle protein K  39.78 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.16105  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0074  gas vesicle protein GVPa  44.29 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112832  decreased coverage  0.000485271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2332  gas vesicle K  41.1 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1487  gas vesicle K  32.39 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.48089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0072  gas vesicle K  32.39 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.349915  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0340  Gas vesicle K  34.18 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>