13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4654 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4654  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299932  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8078  hypothetical protein  73 
 
 		 200 aa  305  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429436  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4971  hypothetical protein  72.14 
 
 		 201 aa  293  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4312  hypothetical protein  71.57 
 
 		 201 aa  290  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.302442  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4891  hypothetical protein  70 
 
 		 200 aa  287  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.632604 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4735  hypothetical protein  66.67 
 
 		 201 aa  272  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4474  hypothetical protein  64.18 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295674  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0263  hypothetical protein  62.19 
 
 		 201 aa  263  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9160  hypothetical protein  69.83 
 
 		 179 aa  262  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9538  hypothetical protein  57.5 
 
 		 241 aa  234  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145256  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6183  protein of unknown function DUF1419  50 
 
 		 205 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0293279 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4599  hypothetical protein  47.89 
 
 		 197 aa  184  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475325  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4149  hypothetical protein  46.91 
 
 		 209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>