13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9538 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9538  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145256  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4735  hypothetical protein  63.18 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8078  hypothetical protein  61 
 
 		 200 aa  254  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429436  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4971  hypothetical protein  60.7 
 
 		 201 aa  252  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4891  hypothetical protein  60.82 
 
 		 200 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.632604 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0263  hypothetical protein  57.21 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4474  hypothetical protein  57.71 
 
 		 201 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295674  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4654  hypothetical protein  57.5 
 
 		 199 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299932  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4312  hypothetical protein  55.22 
 
 		 201 aa  231  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.302442  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9160  hypothetical protein  59.02 
 
 		 179 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6183  protein of unknown function DUF1419  52.02 
 
 		 205 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0293279 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4149  hypothetical protein  42.49 
 
 		 209 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4599  hypothetical protein  43.01 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>