13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0263 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0263  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4474  hypothetical protein  80.1 
 
 
201 aa  336  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295674  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8078  hypothetical protein  69.35 
 
 
200 aa  295  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429436  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4971  hypothetical protein  67.66 
 
 
201 aa  289  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4735  hypothetical protein  65.17 
 
 
201 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4891  hypothetical protein  63.96 
 
 
200 aa  272  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.632604 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4654  hypothetical protein  62.19 
 
 
199 aa  263  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299932  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4312  hypothetical protein  63.18 
 
 
201 aa  262  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.302442  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9160  hypothetical protein  68.16 
 
 
179 aa  255  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9538  hypothetical protein  57.21 
 
 
241 aa  239  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145256  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6183  protein of unknown function DUF1419  56.19 
 
 
205 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0293279 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4149  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4599  hypothetical protein  49.49 
 
 
197 aa  184  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>