36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1184 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1184  Phage uncharacterized protein-like  100 
 
 
493 aa  1013    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0801  Phage uncharacterized protein-like  43.41 
 
 
466 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814229  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0814  phage uncharacterized protein  43.05 
 
 
451 aa  360  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.93566  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0804  phage uncharacterized protein  43.24 
 
 
485 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1016  phage uncharacterized protein  36.9 
 
 
487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0660227  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0377  Phage uncharacterized protein, C-terminal  35.99 
 
 
469 aa  312  6.999999999999999e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0430074  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0665  phage uncharacterized protein  35.51 
 
 
469 aa  311  2e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.410967  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0967  phage uncharacterized protein  38.78 
 
 
465 aa  303  5.000000000000001e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.451476  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0302  chaperone and heat shock protein 70  33.88 
 
 
484 aa  192  9e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.763978  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1048  phage uncharacterized protein  32.72 
 
 
516 aa  189  7e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0343018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3004  Phage uncharacterized protein-like  32.48 
 
 
484 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1307  hypothetical protein  32.49 
 
 
505 aa  187  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2266  phage uncharacterized protein  32.43 
 
 
512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  hitchhiker  0.000265113 
 
 
-
 
NC_002978  WD1132  phage uncharacterized protein  37.41 
 
 
295 aa  185  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00823  phage uncharacterized protein  32.19 
 
 
913 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1212  phage uncharacterized protein  32.46 
 
 
461 aa  183  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6558  phage uncharacterized protein  31.41 
 
 
494 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0181003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0224  phage uncharacterized protein  29.2 
 
 
488 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2388  Phage uncharacterized protein, C-terminal  30.35 
 
 
516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5956  phage uncharacterized protein  31.47 
 
 
456 aa  170  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3556  phage uncharacterized protein  30.82 
 
 
490 aa  170  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6997  phage uncharacterized protein  30.45 
 
 
491 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2507  phage uncharacterized protein  29.79 
 
 
461 aa  145  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2841  phage uncharacterized protein  27.75 
 
 
522 aa  140  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  31.06 
 
 
492 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0542  phage uncharacterized protein  28.67 
 
 
495 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0957  hypothetical protein  26.97 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000035245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2225  phage uncharacterized protein  26.62 
 
 
547 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0340068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  26.84 
 
 
496 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2971  phage uncharacterized protein  24.63 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000566007  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0014  hypothetical protein  21.99 
 
 
484 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1133  Phage terminase, large subunit  25.94 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.151722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1778  hypothetical protein  26.7 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.187909  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4252  hypothetical protein  24.43 
 
 
554 aa  50.1  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2305  phage uncharacterized protein, putative  25 
 
 
491 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2432  phage uncharacterized protein  44.07 
 
 
462 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.694395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>