17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2305 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2305  phage uncharacterized protein, putative  100 
 
 		 491 aa  1022    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0639  hypothetical protein  55.11 
 
 		 519 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0679794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2556  Phage uncharacterized protein-like  53.26 
 
 		 505 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1106  phage uncharacterized protein-like protein  46.86 
 
 		 601 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00823  phage uncharacterized protein  25.71 
 
 		 913 aa  70.5  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0967  phage uncharacterized protein  24 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.451476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2225  phage uncharacterized protein  29.15 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0340068  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0801  Phage uncharacterized protein-like  27.27 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0804  phage uncharacterized protein  25.96 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1132  phage uncharacterized protein  23.67 
 
 		 295 aa  57  0.0000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0377  Phage uncharacterized protein, C-terminal  22.27 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0430074  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0665  phage uncharacterized protein  22.69 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.410967  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1016  phage uncharacterized protein  23.58 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0660227  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0224  phage uncharacterized protein  21.75 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1212  phage uncharacterized protein  24.41 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1184  Phage uncharacterized protein-like  25 
 
 		 493 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3556  phage uncharacterized protein  22.94 
 
 		 490 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>