22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4616 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4616  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  100 
 
 
312 aa  589  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.146651  normal  0.902168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  32.19 
 
 
544 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  26.2 
 
 
405 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  25.47 
 
 
463 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  24.81 
 
 
388 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  24.81 
 
 
388 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  24.81 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  25.47 
 
 
455 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  24.53 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  26.07 
 
 
418 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.43 
 
 
412 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  25.42 
 
 
619 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  27.48 
 
 
899 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  25.11 
 
 
362 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  26.57 
 
 
666 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  24.35 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  25.99 
 
 
475 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  25.99 
 
 
475 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  25.99 
 
 
475 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  25.2 
 
 
926 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  25.97 
 
 
425 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  26.32 
 
 
478 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>