12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1685 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4171  Oligopeptide transporter OPT superfamily protein  64.11 
 
 		 566 aa  702    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1685  Oligopeptide transporter OPT superfamily protein  100 
 
 		 549 aa  1060    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0732845  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0209  hypothetical protein  50.85 
 
 		 519 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0254  Oligopeptide transporter OPT superfamily protein  48.57 
 
 		 542 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5542  hypothetical protein  48.6 
 
 		 536 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2317  membrane protein  49.71 
 
 		 539 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.530716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3296  oligopeptide transporter OPT superfamily protein  49.72 
 
 		 524 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1103  oligopeptide transporter OPT superfamily protein  49.26 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1023  oligopeptide transporter OPT superfamily protein  47.23 
 
 		 524 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.704966 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2688  Oligopeptide transporter OPT superfamily protein  39 
 
 		 547 aa  352  8e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000497009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0706  oligopeptide transporters, OPT superfamily  24.27 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000176165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 530 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>