11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5010 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5010  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  374  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1997  hypothetical protein  42.31 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00570092  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3450  hypothetical protein  34.68 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4998  putative transmembrane protein  31.32 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2781  proline rich protein membrane protein  34.75 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2413  hypothetical protein  27.87 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000208245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1653  hypothetical protein  28.86 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0962873  normal  0.602883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2114  hypothetical protein  28.9 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.62359  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2415  hypothetical protein  33.06 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535569  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1379  putative transmembrane protein  29.26 
 
 
196 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677817  normal  0.543025 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11750  transmembrane protein  28.47 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.16938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>