9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1997 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1997  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  377  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00570092  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5010  hypothetical protein  43.94 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3450  hypothetical protein  32.97 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11750  transmembrane protein  33.85 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2413  hypothetical protein  28.74 
 
 
186 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000208245  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4998  putative transmembrane protein  28.86 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2415  hypothetical protein  31.3 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1653  hypothetical protein  33.33 
 
 
198 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0962873  normal  0.602883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2114  hypothetical protein  31.84 
 
 
202 aa  41.2  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.62359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>