12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1379 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1379  putative transmembrane protein  100 
 
 
196 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677817  normal  0.543025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4998  putative transmembrane protein  56.92 
 
 
195 aa  211  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11750  transmembrane protein  36.3 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3403  putative transmembrane protein  35.68 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431001  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3466  putative transmembrane protein  35.68 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0344404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3414  putative transmembrane protein  35.68 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171016  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0976  hypothetical protein  51.02 
 
 
139 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2114  hypothetical protein  36.15 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.62359  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1997  hypothetical protein  29.94 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00570092  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2413  hypothetical protein  27.37 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000208245  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0763  hypothetical protein  32.37 
 
 
197 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2415  hypothetical protein  35.37 
 
 
195 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>