16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11750 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11750  transmembrane protein  100 
 
 
210 aa  418  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3403  putative transmembrane protein  42.36 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431001  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3466  putative transmembrane protein  42.36 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0344404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3414  putative transmembrane protein  42.36 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171016  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4998  putative transmembrane protein  35.23 
 
 
195 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1379  putative transmembrane protein  34.55 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677817  normal  0.543025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1997  hypothetical protein  32.04 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00570092  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2415  hypothetical protein  38.69 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3450  hypothetical protein  31.05 
 
 
192 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2114  hypothetical protein  31.98 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.62359  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2413  hypothetical protein  30.99 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000208245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2781  proline rich protein membrane protein  37.4 
 
 
196 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4101  hypothetical protein  26.44 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16057  normal  0.20865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1653  hypothetical protein  30.52 
 
 
198 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0962873  normal  0.602883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0976  hypothetical protein  40 
 
 
139 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5010  hypothetical protein  28.29 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>