12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3450 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3450  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1997  hypothetical protein  32.97 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00570092  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1653  hypothetical protein  35.46 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0962873  normal  0.602883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2114  hypothetical protein  31.15 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.62359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11750  transmembrane protein  32.41 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2415  hypothetical protein  31.97 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000535569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5010  hypothetical protein  32.85 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4101  hypothetical protein  32.31 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.16057  normal  0.20865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2413  hypothetical protein  28.25 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000208245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2781  proline rich protein membrane protein  33.08 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4998  putative transmembrane protein  26.03 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3160  hypothetical protein  29.22 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0418164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>