33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4964 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  328  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02610  Protein of unknown function (DUF2505)  31.9 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.344177  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  32.5 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  32.92 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  32.92 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  32.92 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3116  hypothetical protein  33.14 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.02824  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  31.13 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0091  hypothetical protein  34.13 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3383  hypothetical protein  29.09 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10489  hypothetical protein  28.92 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.224481  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3648  Protein of unknown function DUF2505  24.24 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0644  hypothetical protein  28.48 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0664  hypothetical protein  28.48 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0157573  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0651  hypothetical protein  28.48 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3647  Protein of unknown function DUF2505  29.24 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  31.88 
 
 
170 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1222  hypothetical protein  28.95 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0779  Protein of unknown function DUF2505  25.95 
 
 
166 aa  60.8  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2849  hypothetical protein  25.45 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2866  hypothetical protein  25.45 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2822  hypothetical protein  25.45 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2830  hypothetical protein  28.57 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257591  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3048  hypothetical protein  22.54 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.323444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2398  Protein of unknown function DUF2505  28.23 
 
 
171 aa  51.2  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3798  hypothetical protein  26.83 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20520  Protein of unknown function (DUF2505)  27.92 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0605599  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08750  Protein of unknown function (DUF2505)  24.68 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131074  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  28.39 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0780  Protein of unknown function DUF2505  20.37 
 
 
169 aa  44.7  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576817  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1815  Protein of unknown function DUF2505  24.32 
 
 
394 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553226  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05540  hypothetical protein  34.74 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2610  hypothetical protein  28.68 
 
 
170 aa  41.2  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>