17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08750 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_08750  Protein of unknown function (DUF2505)  100 
 
 
164 aa  330  5e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131074  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1241  hypothetical protein  38.18 
 
 
176 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1296  proteinase inhibitor I25 cystatin  33.33 
 
 
165 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20520  Protein of unknown function (DUF2505)  36.67 
 
 
168 aa  84  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0605599  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3798  hypothetical protein  35.17 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2398  Protein of unknown function DUF2505  31.71 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024135 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05540  hypothetical protein  32.56 
 
 
175 aa  72  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2830  hypothetical protein  31.52 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257591  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  27.81 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2610  hypothetical protein  30.18 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1815  Protein of unknown function DUF2505  28.92 
 
 
394 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553226  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1883  hypothetical protein  28.38 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1222  hypothetical protein  20.99 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  24.68 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  24.69 
 
 
163 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3116  hypothetical protein  26.71 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.02824  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0779  Protein of unknown function DUF2505  23.68 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>