25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20520 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_20520  Protein of unknown function (DUF2505)  100 
 
 
168 aa  329  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0605599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1241  hypothetical protein  33.73 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1296  proteinase inhibitor I25 cystatin  34.34 
 
 
165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2398  Protein of unknown function DUF2505  35.48 
 
 
171 aa  99  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024135 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08750  Protein of unknown function (DUF2505)  37.2 
 
 
164 aa  97.4  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131074  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08430  Protein of unknown function (DUF2505)  31.71 
 
 
170 aa  84.3  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05540  hypothetical protein  36.76 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2830  hypothetical protein  35.81 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257591  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2610  hypothetical protein  37.14 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3798  hypothetical protein  36.89 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1222  hypothetical protein  28.05 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  29.94 
 
 
163 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  29.79 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  29.79 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  29.79 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  28.82 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  26.95 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  24.31 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0091  hypothetical protein  26.9 
 
 
173 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1815  Protein of unknown function DUF2505  31.14 
 
 
394 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.553226  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1883  hypothetical protein  28.44 
 
 
163 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2849  hypothetical protein  25.56 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2866  hypothetical protein  25.56 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2822  hypothetical protein  25.56 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3383  hypothetical protein  29.93 
 
 
168 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>